بالرغم من مشاركته الفاعلة في انقلاب الثالث من يوليو، وتعيينه نائبا لرئيس الجمهورية المعين، طلب مصطفي بكري بسحب قلادة النيل من الدكتور محمد البرادعي، زاعماً امتلاك الدولة لتسجيلات تدينه بالتآمر ضد مصر .
وشدد بكرى عبر حسابه الرسمي على "تويتر": "بعد ثبوت تآمر البرادعى ضد مصر، وامتلاك الدولة لتسجيلات خطيرة له يتآمر فيها على أمن البلاد يجب فورا سحب قلادة النيل التى منحها له الرئيس".