كشفت صحيفة "إسرائيل اليوم " نقلاً عن صحيفة جنوب سودانية أن مسئولين إسرائيليين يقومون بتدريب وتسليح جيش جنوب السودان، مشيرة إلى أن وبحسب التقرير الذي نشرته الصحيفة الجنوب سودانية فإن طائرات إسرائيلية تهبط يومياً في مطار ربكونا في جنوب السودان.
وأكدت الصحيفة أن الطائرات تقوم بإفراغ ما لديها من صواريخ ووسائل حربية وأسلحة فضلاً عن نقل مرتزقة من أفريقيا مهيئون للقتال من أجل مساعد جيش جنوب السودان لمحاربة دولة السودان وإسقاط نظام الرئيس السوداني عمر البشير.
وكانت جنوب السودان قررت في وقت سابق فتح سفارة لها في مدينة القدس وليس في العاصمة السياسية "تل أبيب"، في حين كانت وزارة الخارجية الإسرائيلية قد عينت سفيراً غير مقيم لها في دولة جنوب السودان حديثة العهد، وكان وزير الخارجية "أفيغدور ليبرمان" قد وعد ممثلين من جنوب السودان في وقت سابق بتعيين سفير "لإسرائيل" في جوبا عاصمة هذه الجمهورية وقد قرر الجانبان تشكيل لجنة مشتركة تنظر في التعاون بين البلدين خلال السنوات المقبلة.