في إطار حملته المستمرة لتصفية معارضي الانقلاب طالب الدكتور محمد مختار جمعة، وزير أوقاف الانقلاب، بإقصاء من ينتمون تنظيميًا إلى جماعة الإخوان المسلمين، ومن انضموا إلى علماء ضد الانقلاب قبل بداية العام الدراسي الحالي، عن المواقع القيادية المؤثرة بالجامعة ما داموا يدينون للجماعة بالولاء، وفقا لادعاءات الوزير الانقلابي .
وقال في بيان له: "إن الاجتماع الأخير بخصوص جامعة الأزهر في لجنة إصلاح التعليم بحضور القائم بأعمال رئيس الجامعة د. محمد عبد الشافي وثلاثة من النواب، شهد مصارحة ومواجهة الواقع، والاتفاق على ضرورة مواجهة المتشددين والمنتمين تنظيميًا إلى جماعة الإخوان، ومن انضموا إلى علماء ضد الانقلاب، وهم جميعًا معروفون بأسمائهم ومواقعهم، إذ ينبغي التعامل معهم بكل شجاعة وحسم".