يعاني آلاف من سكان محافظة "سوهاج" وقراها ومراكزها من تفشي الأمراض الخطيرة والمزمنة، لتلوث مياه الشرب وزيادة نسبة المنجنيز، ومركبات أخرى فيها أكثر خطورة على حياة المواطنين.
يقول شهود عيان إن المحافظة تعانى من تلوث مياه الشرب منذ زمن طويل، لدرجة أن بعض أهالي المدينة والقرى يحضرون حاجاتهم من المياه من مناطق أخرى غير مناطقهم التى يقطنون بها، والبعض يقوم بشراء فلاتر لتنقية مياه الشرب، حرصًا على صحتهم وصحة ذويهم، في ظل تقاعس الأجهزة المعنية عن تجديد العديد من محطات المياه داخل المحافظة، كمحطة مياه حى غرب، بالإضافة إلى عدم الانتهاء من إنشاء محطات مياه أخرى كان مُقرر إنشائها فى مركز "طما" و"ساقلته" و"دار السلام" و"المنشأة" و"البلينا".
يُذكر أن مُعظم القرى والمراكز داخل المحافظة يتم تغذيتها بالمياه عن طريق الأبار الإرتوازية، وهى توصف بإرتفاع نسبة المنجنيز والحديد والأملاح بها.